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ESM

この ESM 項目は Meta FAIR の公式リポジトリを対象とし、ESM-2 のタンパク質表現と ESMFold の構造予測を含みます。

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概要

他のタンパク質モデルや例も公開されています。範囲は facebookresearch/esm に限定し、別プロジェクトの ESM3 などの機能やライセンスを混在させません。

制約

公式リポジトリはアーカイブ済みです。旧 ESMFold 環境、OpenFold、CUDA の依存関係を確認し、現行環境への対応や継続的な保守を断定しないでください。

主な機能

  • タンパク質配列表現の抽出
  • ESMFold による構造予測

用途

  • タンパク質埋め込みの研究
  • 公開された構造予測手順の再現

使い方

README でモデルと用途を選び、対応する依存関係を準備します。公式例を実行し、モデル名と重みの出典を記録してください。