MCP Servers

ChemGraph は、自然言語による化学リクエストを分子構築、シミュレーション、解析、レポート作成につなぐ Python エージェントフレームワークで、CLI、Python、Streamlit、MCP のインターフェースを備えています。

計算化学 · 材料探索

ChemCP は、RDKit.js を使って SMILES 文字列からインタラクティブな2D分子図と計算記述子を生成し、MCP Apps 対応ホスト向けにチャット内ビューアを提供する MCP App です。

ケモインフォマティクス

NovoMCPは、MCPとRESTを通じて計算化学ツールを提供し、分子プロファイリング、設定可能なシミュレーションサービス、創薬ファネルのオーケストレーション、ツール呼び出しの監査を組み合わせています。

計算化学 · 創薬

PocketScout MCPは、公開されている構造、生物活性、保存性、変異、文献のデータを用いて既知のタンパク質結合部位を評価するためのツールをAIアシスタントに提供し、標的選定や結合タンパク質設計を支援します。

創薬 · 科学データ

Benchling MCP (longevity-genie) は、API認証情報を使用してAIクライアントをBenchlingのノートブック項目、生物学的配列、プロジェクト、エンティティ検索に接続するPython製MCPサーバーです。

ラボ自動化 · 科学データ

PubMed MCP (cyanheads) は、AI クライアントを生物医学文献検索、論文メタデータ、利用可能な全文、MeSH 語彙、引用ツールに接続するサードパーティ製 MCP サーバーです。

文献・研究 · 創薬

mp_api を介して Materials Project とアシスタントクライアントを接続し、材料検索、結晶構造、電子物性などの材料データを扱うサードパーティ製 MCP サーバーです。

材料探索 · 科学データ

RCSB MCP (cnyambura) は、RCSB PDB のエントリおよびポリマーのメタデータ、構造ファイルのダウンロード、カスタム Data API クエリを MCP クライアントに提供するサードパーティ製 MCP サーバーです。

創薬 · 科学データ

UniProt MCP (cyanheads) は、AI クライアントを UniProt のタンパク質検索、注釈、識別子マッピング、プロテオーム、分類学、アミノ酸配列に接続するサードパーティ製 MCP サーバーです。

創薬 · 科学データ

RDKit MCP Server (TandemAI) は、MCP 対応の言語モデルを RDKit ツールに接続します。また、OpenAI を利用するコマンドラインクライアントと、ツール出力およびエージェント応答を評価するための評価スイートを備えています。

ケモインフォマティクス

PubChem MCP (PhelanShao) は、AI クライアントが名前または CID で PubChem の化合物特性や構造を取得できる Python MCP サーバーです。JSON、CSV、XYZ 形式での出力に加え、構造ファイルのダウンロードにも対応します。

ケモインフォマティクス · 科学データ

ChEMBL MCP (cyanheads) は、MCP クライアントを ChEMBL の化合物、標的、生物活性、医薬品の記録に接続し、構造検索と、オプションで DuckDB を用いた大規模な活性データセットの分析を提供します。

創薬 · 科学データ

PubChem MCP (cyanheads) は MCP クライアントを PubChem の化合物およびバイオアッセイデータに接続し、識別子や構造による検索、物性の取得、安全性記録、相互参照、3D配座に対応します。

ケモインフォマティクス · 科学データ