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OpenFold

OpenFold は AlphaFold 2 を PyTorch で実装した学習可能なソフトウェアで、タンパク質構造の推論と学習に利用できます。

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概要

対象は構造予測の研究とモデル再現であり、一般的な化学物性予測器とは異なります。公式資料では導入、推論、学習の手順を区別しています。

制約

コードは Apache-2.0 です。README では DeepMind の学習済みパラメータに CC BY 4.0 が適用されるため、コード・重み・データの条件を個別に確認してください。

主な機能

  • タンパク質構造の推論
  • 学習可能な AlphaFold 2 実装

用途

  • 構造予測手順の再現
  • 構造モデル学習の研究

使い方

公式の導入資料で依存関係とパラメータを準備し、推論または学習を選択します。タンパク質入力と実行設定を保存してください。