Claude Desktop から reviewed UniProtKB 記録を取得し、種と accession を明確にして機能の根拠と出典識別子を保持します。
Claude Desktop に Node.js >=24 と @cyanheads/uniprot-mcp-server 0.2.4 を使用します。公開 UniProt 検索は API キー不要です。ローカル MCP は外部 UniProt API を使用し、取得注釈は Claude に渡ります。既存記録の取得であり、新しい構造や臨床予測ではありません。
ヒトは taxon 9606 に限定し reviewed 状態を記録します。遺伝子名だけでは曖昧になり得ます。詳細は標準 accession を使い、アイソフォーム接尾辞と予測配列は別途扱います。注釈や相互参照はデータベース版に依存するため出典、取得日、根拠ラベルを保持します。
UniProt MCP (cyanheads)
UniProt 記録取得 · 0.2.4
固定 npm パッケージ。オンライン注釈は変化し得ます。
上流のライセンスとクライアント・サービスの利用条件を確認してください。
リソースを見る| クライアント | OS | アーキテクチャ | バージョン要件 |
|---|---|---|---|
| Claude Desktop | macOS | 指定なし | 構成リソースの要件を参照 |
| Claude Desktop | Windows | 指定なし | 構成リソースの要件を参照 |
全プラットフォーム
npm を含む Node.js 24 以降と Claude Desktop を導入します。ローカル MCP が許可され、対象データベースへ HTTPS 接続できることを確認します。この Node 構成では Bun は不要です。
node --version
npm --version
Node は v24 以降、npm が利用できる。
全プラットフォーム
新しい書き込み可能な作業ディレクトリで実行します。.mcp-packages に導入し、検証用に lockfile を保持します。上流の npx とローカル dist/index.js は同じ公開パッケージを使用します。
npm install --prefix .mcp-packages @cyanheads/[email protected]
npm ls --prefix .mcp-packages --depth=0
指定した正確なパッケージ版が導入される。
macOS
Settings > Developer > Edit Config で mcpServers に追加します。node 実行ファイルも含め、すべてを実際の絶対パスに置き換え、既存項目を保持します。基本検索は API キー不要です。任意のキーやメールアドレスは私有設定に保存します。
{
"mcpServers": {
"uniprot-mcp-server": {
"command": "/ABSOLUTE/PATH/TO/node",
"args": [
"/ABSOLUTE/PATH/.mcp-packages/node_modules/@cyanheads/uniprot-mcp-server/dist/index.js"
],
"env": {
"MCP_TRANSPORT_TYPE": "stdio"
}
}
}
}有効な JSON が Node 24 以降で導入済みパッケージを stdio 起動する。
Windows
Settings > Developer > Edit Config で mcpServers に追加します。node 実行ファイルも含め、すべてを実際の絶対パスに置き換え、既存項目を保持します。基本検索は API キー不要です。任意のキーやメールアドレスは私有設定に保存します。
{
"mcpServers": {
"uniprot-mcp-server": {
"command": "C:\\ABSOLUTE\\PATH\\TO\\node.exe",
"args": [
"C:\\ABSOLUTE\\PATH\\.mcp-packages\\node_modules\\@cyanheads\\uniprot-mcp-server\\dist\\index.js"
],
"env": {
"MCP_TRANSPORT_TYPE": "stdio"
}
}
}
}有効な JSON が Node 24 以降で導入済みパッケージを stdio 起動する。
全プラットフォーム
Claude Desktop を完全に終了して再起動し、Developer 状態とコネクター一覧を調べます。必要なツール：uniprot_search_proteins, uniprot_get_entry。
接続が成功し、指定したツールが利用できる。
全プラットフォーム
新規チャットに入力し二つの実際の呼び出しを確認。
uniprot_search_proteins を query gene:TP53 AND organism_id:9606、reviewed=true で呼び出し、得られたヒト TP53 の標準エントリーを uniprot_get_entry で取得してください。accession、reviewed、遺伝子、種、配列長、機能、根拠の引用、UniProt リンク、取得日を示し、P04637 か確認してください。不明な注釈を保持し、臨床推奨に置き換えないでください。参照基準：reviewed のヒト TP53、P04637、標準配列長 393。取得記録と https://www.uniprot.org/uniprotkb/P04637/entry を照合し、変異体やアイソフォームは別に表示します。今回の実行結果ではありません。
全プラットフォーム
上流ツールは text_search または query の一方だけを許可します。
uniprot_search_proteins に text_search="TP53" と query="gene:TP53" の両方を渡し、検証エラーを報告し、エントリーを作らないでください。競合する要求が拒否される。
UniProt サイトや REST API を直接利用できます。構造記録は別の RCSB ワークフローで扱い、UniProt 注釈だけで構造品質を判断しません。