ケモインフォマティクス

PubChem PUG RESTは、選択した化学レコード、物性、アッセイ情報を取得するHTTP APIです。文書で説明されている識別子入力、構造検索、操作ごとの出力形式に対応しています。

ケモインフォマティクス · 科学データ

化学情報学のワークフローで rdkit-agent を使うための指示 Skill です。化学表記の検証、構造化 JSON による受け渡し、出力範囲の制限、および文書化された RDKit WASM の制約を重視しています。

ケモインフォマティクス

Datamol に基づく分子調製、類似性分析、骨格ワークフロー、コンフォマー処理を案内し、入力検証と再現性に関するガイダンスも提供する K-Dense Scientific Agent Skill。

ケモインフォマティクス · 創薬

RDKit Skill (K-Dense) は、分子の解析、記述子計算、類似性スクリーニング、部分構造フィルタリング、構造操作のための手順ガイド、参考資料、Python ヘルパーを提供します。

ケモインフォマティクス

ChemCP は、RDKit.js を使って SMILES 文字列からインタラクティブな2D分子図と計算記述子を生成し、MCP Apps 対応ホスト向けにチャット内ビューアを提供する MCP App です。

ケモインフォマティクス

RDKit MCP Server (TandemAI) は、MCP 対応の言語モデルを RDKit ツールに接続します。また、OpenAI を利用するコマンドラインクライアントと、ツール出力およびエージェント応答を評価するための評価スイートを備えています。

ケモインフォマティクス

Chemistry Development Kit (CDK) は、他のプログラム内で化学表現、ファイル変換、構造検索、フィンガープリント、QSAR記述子の計算、分子レンダリングに利用できる Java ライブラリです。

ケモインフォマティクス

Open Babel は、形式変換、分子検索、2D または 3D 座標生成に利用できる、すぐに使えるプログラムと Python インターフェースを備えた化学データツールキットです。

ケモインフォマティクス

Mordredは、コマンドラインとRDKitベースのライブラリワークフローを備えたPython分子記述子計算ツールです。ケモインフォマティクス解析や下流のモデル評価に使用する記述子テーブルを生成します。

分子特性予測 · ケモインフォマティクス

SELFIES は、SMILES の変換、token エンコーディングの準備、設定可能な意味制約下での分子グラフ生成に使用できる、分子文字列表現形式および Python ライブラリです。

分子生成 · ケモインフォマティクス

Datamol は RDKit を基盤とする Python 分子処理ライブラリで、構造変換、標準化、フィンガープリント、配座生成、可視化、ローカルまたはリモートのファイル I/O 用ツールを備えています。

ケモインフォマティクス

Molfeat は、小分子の特徴量化のための Python ツールキットです。分子フィンガープリント、記述子、事前学習済み埋め込みに、並列変換、キャッシュ、拡張可能なプラグインを組み合わせています。

分子特性予測 · ケモインフォマティクス

PubChemPy は PubChem PUG REST API の Python ラッパーで、化学物質の検索、化合物の特性取得、標準化、ファイル形式の変換、構造描画をサポートします。

ケモインフォマティクス · 科学データ

PubChem MCP (PhelanShao) は、AI クライアントが名前または CID で PubChem の化合物特性や構造を取得できる Python MCP サーバーです。JSON、CSV、XYZ 形式での出力に加え、構造ファイルのダウンロードにも対応します。

ケモインフォマティクス · 科学データ

PubChem MCP (cyanheads) は MCP クライアントを PubChem の化合物およびバイオアッセイデータに接続し、識別子や構造による検索、物性の取得、安全性記録、相互参照、3D配座に対応します。

ケモインフォマティクス · 科学データ

Scientific Agent Skills は、ケモインフォマティクス、分光学、材料分析などを含む、科学ソフトウェアパッケージ、データベース、研究ワークフローを扱う AI エージェント向けの手順ガイダンスを提供します。

ケモインフォマティクス · 科学データ

ChemCrow は、Langchain を用いて構築された Python 化学エージェントパッケージで、言語モデルの推論を RDKit、paper-qa、化学データベース、反応計画ツールに接続します。

ケモインフォマティクス · 文献・研究

RxnMapperは、教師なしALBERTモデルの注意機構を用いて、有効な反応SMILESに原子マッピングを割り当て、Pythonインターフェースを通じてマッピング済み反応と信頼度スコアを返します。

ケモインフォマティクス · 反応予測

RDKit は、2D および 3D 分子操作、記述子とフィンガープリントの生成、PostgreSQL cartridge を介した化学検索に対応するオープンソースのケモインフォマティクス・ツールキットです。

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