OpenMM は分子シミュレーションのツールキットです。公式の OpenMM-ML 拡張を通じて機械学習ポテンシャルを利用できます。
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コアはシミュレーションと力計算の基盤を提供します。学習モデルには OpenMM-ML とモデル用パッケージの別途導入が必要で、すべてがコアに同梱されるわけではありません。
制約
OpenMM は部品ごとにライセンスが異なります。OpenMM-ML とモデル依存関係は別途導入してください。本作業では導入や動力学の実行確認はしていません。
OpenMM の資料と公式 OpenMM-ML README を読み、エンジン、拡張、モデルをそれぞれ準備します。公式の体系構築例に従って適用範囲を確認してください。
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computational-chemistry-agent-skills コレクションに含まれる ASE ルーティング Skill。ワークフローの準備と計算器の設定を分け、実行は別の担当先に委任します。
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Cantera Skill (K-Dense) は、均相着火計算の手順と Python ヘルパーを提供し、機構の出典記録、保存則の診断、数値的な細分化チェックを含みます。
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ChemAgentは、問題を分解し再利用可能なメモリを検索する化学推論研究フレームワークです。メモリプールの構築とSciBench実験の実行に使えるコードが公開されています。
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材料研究向けのポテンシャルとフレームワークを、学習領域、出力、計算器、資産の権利、参照検証から比較します。
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