MCP Servers

ChemGraph 是一个 Python 智能体框架，可将自然语言化学请求连接到分子构建、模拟、分析和报告，并提供 CLI、Python、Streamlit 和 MCP 接口。

计算化学 · 材料发现

ChemCP 是一款 MCP App，可使用 RDKit.js 将 SMILES 字符串转换为交互式二维分子图和计算描述符，并为支持 MCP Apps 的主机提供聊天内查看器。

化学信息学

NovoMCP 通过 MCP 和 REST 提供计算化学工具，结合分子画像分析、可配置的模拟服务、发现漏斗编排和工具调用审计。

计算化学 · 药物发现

PocketScout MCP 帮助 AI 助手利用公开的结构、生物活性、保守性、变异和文献数据评估已知蛋白结合位点，为靶点筛选或结合蛋白设计提供依据。

药物发现 · 科学数据

Benchling MCP (longevity-genie) 是一个 Python MCP 服务器，通过 API 凭据将 AI 客户端连接到 Benchling 的笔记本条目、生物序列、项目和实体搜索功能。

实验室自动化 · 科学数据

PubMed MCP (cyanheads) 是一个第三方 MCP 服务器，可将 AI 客户端连接到生物医学文献检索、文章元数据、可获取的全文、MeSH 词表和引文工具。

文献与研究 · 药物发现

一款第三方 MCP 服务器，通过 mp_api 将助手客户端接入 Materials Project，提供材料搜索、晶体结构、电子性质及其他材料数据查询工具。

材料发现 · 科学数据

RCSB MCP (cnyambura) 是一个第三方 MCP 服务器，可向 MCP 客户端提供 RCSB PDB 条目和聚合物元数据、结构下载及自定义 Data API 查询。

药物发现 · 科学数据

UniProt MCP (cyanheads) 是一个第三方 MCP 服务器，可将 AI 客户端连接到 UniProt 的蛋白质搜索、注释、标识符映射、蛋白质组、分类学和氨基酸序列数据。

药物发现 · 科学数据

RDKit MCP Server (TandemAI) 将支持 MCP 的语言模型连接到 RDKit 工具，并提供 OpenAI 驱动的命令行客户端，以及用于评估工具输出和智能体响应的评估套件。

化学信息学

PubChem MCP (PhelanShao) 是一个 Python MCP 服务器，可让 AI 客户端按名称或 CID 检索 PubChem 化合物属性和结构，并提供 JSON、CSV、XYZ 输出以及可下载的结构文件。

化学信息学 · 科学数据

ChEMBL MCP (cyanheads) 将 MCP 客户端连接到 ChEMBL 化合物、靶点、生物活性和药物记录，并支持结构搜索以及可选的 DuckDB 大型活性数据集分析。

药物发现 · 科学数据

PubChem MCP (cyanheads) 将 MCP 客户端连接到 PubChem 化合物和生物测定数据，支持标识符和结构搜索、性质检索、安全记录、交叉引用及 3D 构象。

化学信息学 · 科学数据