科学データ

材料研究データの管理・検索と、NOMAD AI Toolkit による Notebook ベースの分析を提供する学術プラットフォーム。

材料探索 · 科学データ

計算構造や物性を検索し、材料探索と機械学習研究の参照データを準備する学術データプラットフォーム。

材料探索 · 科学データ

RCSB PDB Data API は、REST および GraphQL を通じて、PDB エントリーと一部の計算構造モデルの構造メタデータ、分子配列、化学記述子、注釈にアクセスできます。

創薬 · 科学データ

PubChem PUG RESTは、選択した化学レコード、物性、アッセイ情報を取得するHTTP APIです。文書で説明されている識別子入力、構造検索、操作ごとの出力形式に対応しています。

ケモインフォマティクス · 科学データ

PocketScout MCPは、公開されている構造、生物活性、保存性、変異、文献のデータを用いて既知のタンパク質結合部位を評価するためのツールをAIアシスタントに提供し、標的選定や結合タンパク質設計を支援します。

創薬 · 科学データ

Benchling MCP (longevity-genie) は、API認証情報を使用してAIクライアントをBenchlingのノートブック項目、生物学的配列、プロジェクト、エンティティ検索に接続するPython製MCPサーバーです。

ラボ自動化 · 科学データ

mp_api を介して Materials Project とアシスタントクライアントを接続し、材料検索、結晶構造、電子物性などの材料データを扱うサードパーティ製 MCP サーバーです。

材料探索 · 科学データ

RCSB MCP (cnyambura) は、RCSB PDB のエントリおよびポリマーのメタデータ、構造ファイルのダウンロード、カスタム Data API クエリを MCP クライアントに提供するサードパーティ製 MCP サーバーです。

創薬 · 科学データ

UniProt MCP (cyanheads) は、AI クライアントを UniProt のタンパク質検索、注釈、識別子マッピング、プロテオーム、分類学、アミノ酸配列に接続するサードパーティ製 MCP サーバーです。

創薬 · 科学データ

PubChemPy は PubChem PUG REST API の Python ラッパーで、化学物質の検索、化合物の特性取得、標準化、ファイル形式の変換、構造描画をサポートします。

ケモインフォマティクス · 科学データ

QCArchiveは、データベースを基盤とするサーバー、Pythonクライアント、および同一リポジトリで保守される計算ワーカーを通じて、量子化学計算の実行、保存、共有を支援します。

量子化学 · 科学データ

ChEMBL データとケモインフォマティクスサービスのクエリに使用する、ChEMBL グループが保守する公式 Python クライアント。QuerySet 形式のフィルター、遅延取得、ローカルでの結果キャッシュを備えています。

創薬 · 科学データ

Materials Project API は mp-api として公開されている Python クライアントプロジェクトです。公式のデータアクセス文書と任意の MCP サーバーのエントリーポイントが、パッケージ設定で宣言されています。

材料探索 · 科学データ

PubChem MCP (PhelanShao) は、AI クライアントが名前または CID で PubChem の化合物特性や構造を取得できる Python MCP サーバーです。JSON、CSV、XYZ 形式での出力に加え、構造ファイルのダウンロードにも対応します。

ケモインフォマティクス · 科学データ

ChEMBL MCP (cyanheads) は、MCP クライアントを ChEMBL の化合物、標的、生物活性、医薬品の記録に接続し、構造検索と、オプションで DuckDB を用いた大規模な活性データセットの分析を提供します。

創薬 · 科学データ

PubChem MCP (cyanheads) は MCP クライアントを PubChem の化合物およびバイオアッセイデータに接続し、識別子や構造による検索、物性の取得、安全性記録、相互参照、3D配座に対応します。

ケモインフォマティクス · 科学データ

Scientific Agent Skills は、ケモインフォマティクス、分光学、材料分析などを含む、科学ソフトウェアパッケージ、データベース、研究ワークフローを扱う AI エージェント向けの手順ガイダンスを提供します。

ケモインフォマティクス · 科学データ

SPICE は、機械学習ポテンシャルの学習に利用できる量子力学的エネルギー、力、その他の分子特性を提供します。特に、医薬品様分子とタンパク質の相互作用に重点を置いています。

量子化学 · 科学データ

Open Reaction Database は、Protobuf レコードを含む Parquet ファイル形式の構造化反応データセットを提供します。また、ミラーからのダウンロードと、ストリーミングアクセスやテキストまたは JSON への変換に対応する ord_schema ワークフローを利用できます。

反応予測 · 科学データ