跳转到正文

科学数据

科学数据任务涵盖科学记录的定位、检索与整理,同时保留其标识符、含义和来源与处理记录。

19 个资源

NOMAD

平台

管理与检索材料科研数据的学术平台,可通过 NOMAD AI Toolkit 使用基于 Notebook 的分析流程。

开源

材料发现 · 科学数据

面向材料研究的学术数据平台,可检索计算结构与性质,为材料发现与机器学习研究准备参考数据。

材料发现 · 科学数据

RCSB PDB Data API 提供 REST 和 GraphQL 接口,可访问 PDB 条目及部分计算结构模型的结构元数据、分子序列、化学描述符和注释。

药物发现 · 科学数据

PubChem PUG REST 是一种 HTTP API,可用于获取选定的化学记录、性质和测定信息,并支持文档中列明的标识符输入、结构搜索及按操作区分的输出格式。

化学信息学 · 科学数据

PocketScout MCP 帮助 AI 助手利用公开的结构、生物活性、保守性、变异和文献数据评估已知蛋白结合位点,为靶点筛选或结合蛋白设计提供依据。

开源Python

药物发现 · 科学数据

Benchling MCP (longevity-genie) 是一个 Python MCP 服务器,通过 API 凭据将 AI 客户端连接到 Benchling 的笔记本条目、生物序列、项目和实体搜索功能。

开源Python

实验室自动化 · 科学数据

一款第三方 MCP 服务器,通过 mp_api 将助手客户端接入 Materials Project,提供材料搜索、晶体结构、电子性质及其他材料数据查询工具。

开源Python

材料发现 · 科学数据

RCSB MCP (cnyambura) 是一个第三方 MCP 服务器,可向 MCP 客户端提供 RCSB PDB 条目和聚合物元数据、结构下载及自定义 Data API 查询。

Python

药物发现 · 科学数据

UniProt MCP (cyanheads) 是一个第三方 MCP 服务器,可将 AI 客户端连接到 UniProt 的蛋白质搜索、注释、标识符映射、蛋白质组、分类学和氨基酸序列数据。

开源TypeScript

药物发现 · 科学数据

PubChemPy

开源工具

PubChemPy 是 PubChem PUG REST API 的 Python 封装,支持化学物质搜索、化合物属性检索、标准化、文件格式转换和结构绘制。

开源Python

化学信息学 · 科学数据

QCArchive 通过由数据库支持的服务器、Python 客户端以及在同一代码仓库中维护的计算工作器,支持运行、存储和共享量子化学计算。

开源Python

量子化学 · 科学数据

由 ChEMBL 团队维护的官方 Python 客户端,用于查询 ChEMBL 数据和化学信息学服务,提供 QuerySet 风格的筛选器、惰性检索和本地结果缓存。

开源Python

药物发现 · 科学数据

Materials Project API 是以 mp-api 发布的 Python 客户端项目,其官方数据访问文档和可选 MCP 服务器入口点均在其软件包配置中声明。

开源Python

材料发现 · 科学数据

PubChem MCP (PhelanShao) 是一个 Python MCP 服务器,可让 AI 客户端按名称或 CID 检索 PubChem 化合物属性和结构,并提供 JSON、CSV、XYZ 输出以及可下载的结构文件。

开源Python

化学信息学 · 科学数据

ChEMBL MCP (cyanheads) 将 MCP 客户端连接到 ChEMBL 化合物、靶点、生物活性和药物记录,并支持结构搜索以及可选的 DuckDB 大型活性数据集分析。

开源TypeScript

药物发现 · 科学数据

PubChem MCP (cyanheads) 将 MCP 客户端连接到 PubChem 化合物和生物测定数据,支持标识符和结构搜索、性质检索、安全记录、交叉引用及 3D 构象。

开源TypeScript

化学信息学 · 科学数据

Scientific Agent Skills 为 AI 智能体提供程序性指导,帮助其使用科学软件包、数据库和研究工作流,涵盖化学信息学、光谱学和材料分析等领域。

开源Python

化学信息学 · 科学数据

SPICE

数据集

SPICE 提供量子力学能量、力及其他分子性质,可用于训练机器学习势,重点涵盖类药小分子与蛋白质相互作用。

开源

量子化学 · 科学数据

Open Reaction Database 提供结构化反应数据集,文件格式为包含 Protobuf 记录的 Parquet,并提供镜像下载以及用于流式访问和文本或 JSON 转换的 ord_schema 工作流。

开源Python

反应预测 · 科学数据