QM9 分子性质预测:如何正确评估
明确 QM9 目标和单位,区分分子图与几何输入,防止评估泄漏,并保留原始数据与处理过程的来源记录。
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区分图学习基础设施、等变运算库及面向化学的 DGL 工具包,并从表示、评估和版本边界出发选择。
从训练域、能量与导数输出、计算器接口、模型资产许可及参考验证出发,比较材料研究中的原子间势与框架。
正确解读 Boltz-2 的置信度和亲和力输出,避免把结构分数当作结合测量,或把预测 IC50 当作 Kd。
区分 RFdiffusion 骨架生成、ProteinMPNN 序列设计和 Boltz 预测,理解文件交接、适用条件及实验验证边界。
比较 Chemprop 对分子性质预测的专注方向与 DeepChem 更广泛的科学机器学习范围,然后通过共享数据、明确的输入与输出以及可复现的决策标准,规划公平的评估。