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搭建你的化学 AI 技术栈

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化学数据清洗组合

使用 RDKit 校验并规范化 SMILES,保留原始行、标记重复项,并可选使用 PubChem 补全合法条目的标识。

RDKit + PubChemPy

处理化学数据

难度: 中等 费用: 免费 隐私: 取决于配置 ~30 分钟

Python

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为 Cursor 添加化学 AI 能力

为 Cursor 项目接入固定版本且限定工具的 RDKit MCP,使用可复现 SMILES 提示词核对分子分析调用与结果。

RDKit MCP Server (TandemAI) + RDKit

搭建化学助手

难度: 中等 费用: 免费与付费混合 隐私: 云端 ~30 分钟

Cursor · Python

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化学文献研究组合

搭建面向药物与生物化学的可追溯文献流程:检索 PubMed、获取论文记录,仅依据真实返回内容总结并保留标识与引用。

PubMed MCP (cyanheads)

检索文献

难度: 中等 费用: 免费与付费混合 隐私: 云端 ~30 分钟

Claude Desktop

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使用 Claude + PubChem 开展化学研究

通过本地 PubChem MCP 在 Claude Desktop 中把化学名称解析为 CID,获取带来源的化合物性质,并明确缺失值及计算性质。

PubChem MCP (cyanheads) + PubChem PUG REST

分析分子

难度: 中等 费用: 免费与付费混合 隐私: 云端 ~30 分钟

Claude Desktop

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材料研究入门组合

使用 Materials Project Python API 查询小型材料摘要,保留材料标识、来源与单位,区分计算性质和实验依据。

Materials Project API

材料研究

难度: 中等 费用: 免费与付费混合 隐私: 取决于配置 ~30 分钟

Python

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使用 Claude + RDKit MCP 进行分子分析

将 Claude Desktop 接入本地 RDKit MCP,通过 SMILES 计算分子式、平均与精确分子质量、TPSA 和 Crippen 描述符,并提供可复现的安装配置与验收步骤。

RDKit MCP Server (TandemAI) + RDKit

分析分子

难度: 中等 费用: 免费与付费混合 隐私: 云端 ~30 分钟

Claude Desktop · Python

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使用 UniProt MCP 开展蛋白质研究

通过 Claude Desktop 查询已审核 UniProtKB 蛋白记录,明确物种与 accession,保留功能注释、证据和来源标识。

UniProt MCP (cyanheads)

蛋白质与药物研究

难度: 中等 费用: 免费与付费混合 隐私: 云端 ~30 分钟

Claude Desktop

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蛋白质结构研究组合

结合 RCSB 结构与 UniProt 蛋白注释,检查实验方法、分辨率和实体映射,下载带来源记录的 mmCIF 文件。

UniProt MCP (cyanheads) + RCSB MCP (cnyambura) + RCSB PDB Data API

蛋白质与药物研究

难度: 中等 费用: 免费与付费混合 隐私: 云端 ~45 分钟

Claude Desktop · Python

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