概览
项目提供解析 PDB、选择设计链、固定残基和设置序列约束的辅助脚本。它是结构条件化序列设计模型，不是蛋白质骨架生成器。
限制
需要预先提供适用骨架；仓库默认分支最近提交较早，不能声称当前活跃维护。生成序列仍需后续评价。
主要功能
- 给定骨架的序列设计
- 设计链与残基约束
使用场景
- 为候选蛋白质骨架生成序列
- 评估固定残基条件下的序列候选
使用方式
按 README 准备 Python、PyTorch 和 NumPy，先解析示例 PDB，再使用 protein_mpnn_run.py 选择模型、设计链和约束。