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バックエンドに依存しない Phonopy Skill。有限変位計算の計画、力データの整理、および科学的前提を明示したバンド、状態密度、熱物性解析の手順を支援します。

材料探索

computational-chemistry-agent-skills コレクションに含まれる ASE ルーティング Skill。ワークフローの準備と計算器の設定を分け、実行は別の担当先に委任します。

計算化学 · 材料探索

pycalphad による TDB 平衡計算の手順とローカルヘルパーを含む、K-Dense コレクションの Skill です。モル相分率、組成、数値検証記録を出力します。

材料探索

Cantera Skill (K-Dense) は、均相着火計算の手順と Python ヘルパーを提供し、機構の出典記録、保存則の診断、数値的な細分化チェックを含みます。

計算化学 · プロセス最適化

Pymatgen Skill (K-Dense) は、材料構造の検証、対称性の調査、形式変換の計画、ローカル相図の作成、Materials Project クエリの範囲設定に使うエージェント向け指示と Python ヘルパーを提供します。

材料探索

校正済み1D NMR FID処理の説明とPythonヘルパーを含むK-Dense Skill。位相補正スペクトル、正のピーク候補、符号付き積分、再現可能な処理レポートを生成します。

分光法

Datamol に基づく分子調製、類似性分析、骨格ワークフロー、コンフォマー処理を案内し、入力検証と再現性に関するガイダンスも提供する K-Dense Scientific Agent Skill。

ケモインフォマティクス · 創薬

RDKit Skill (K-Dense) は、分子の解析、記述子計算、類似性スクリーニング、部分構造フィルタリング、構造操作のための手順ガイド、参考資料、Python ヘルパーを提供します。

ケモインフォマティクス

DrugAgentは、LLMによる計画立案とドメイン知識に基づくコード生成を組み合わせ、創薬分野の機械学習ワークフローを構築・評価する研究用マルチエージェントフレームワークです。

分子特性予測 · 創薬

STELLAは、生物医学文献とバイオインフォマティクスのワークフローを対象とした研究用マルチエージェントフレームワークです。再利用可能なワークフローテンプレート、ツールのオーケストレーション、批評、任意の動的なツール作成を組み合わせています。

文献・研究 · 創薬

ChemAgent (AI4Chem) は化学・材料分野でのツール利用を目的とする研究フレームワークであり、木探索による計画、ツール実行、ChemToolBench に基づく学習を扱う CheMatAgent 論文と関連しています。

計算化学 · 材料探索

ChemAgentは、問題を分解し再利用可能なメモリを検索する化学推論研究フレームワークです。メモリプールの構築とSciBench実験の実行に使えるコードが公開されています。

計算化学

SciAgentsは、科学知識グラフ、LLM、検索ツールを活用して、生物に着想を得た材料研究の仮説を作成・批評する研究用マルチエージェントフレームワークです。

文献・研究 · 材料探索

ChatMOFは、言語モデルに導かれるツールを用いて、自然言語によるリクエストからMOFデータを検索し、特性を予測し、構造を生成する、コードが公開された研究システムです。

材料探索

MDCrowは、分子動力学ワークフロー向けのPython製LLMエージェントツールセットです。自然言語による要求を、シミュレーションの設定、OpenMMでの実行、出力解析、科学情報の検索につなぎます。

計算化学

ChemGraph は、自然言語による化学リクエストを分子構築、シミュレーション、解析、レポート作成につなぐ Python エージェントフレームワークで、CLI、Python、Streamlit、MCP のインターフェースを備えています。

計算化学 · 材料探索

ChemCP は、RDKit.js を使って SMILES 文字列からインタラクティブな2D分子図と計算記述子を生成し、MCP Apps 対応ホスト向けにチャット内ビューアを提供する MCP App です。

ケモインフォマティクス

NovoMCPは、MCPとRESTを通じて計算化学ツールを提供し、分子プロファイリング、設定可能なシミュレーションサービス、創薬ファネルのオーケストレーション、ツール呼び出しの監査を組み合わせています。

計算化学 · 創薬

PocketScout MCPは、公開されている構造、生物活性、保存性、変異、文献のデータを用いて既知のタンパク質結合部位を評価するためのツールをAIアシスタントに提供し、標的選定や結合タンパク質設計を支援します。

創薬 · 科学データ

Benchling MCP (longevity-genie) は、API認証情報を使用してAIクライアントをBenchlingのノートブック項目、生物学的配列、プロジェクト、エンティティ検索に接続するPython製MCPサーバーです。

ラボ自動化 · 科学データ