創薬

Boltz は生体分子相互作用の予測モデル群です。Boltz-2 は複合体構造と結合親和性の予測手順を提供します。

創薬

AIDDISON Explorerは、目標プロファイル、設計上の制約、予測物性、合成可能性に基づいて分子候補を生成し、順位付けするホスト型創薬プラットフォームです。

分子生成 · 創薬

RCSB PDB Data API は、REST および GraphQL を通じて、PDB エントリーと一部の計算構造モデルの構造メタデータ、分子配列、化学記述子、注釈にアクセスできます。

創薬 · 科学データ

Datamol に基づく分子調製、類似性分析、骨格ワークフロー、コンフォマー処理を案内し、入力検証と再現性に関するガイダンスも提供する K-Dense Scientific Agent Skill。

ケモインフォマティクス · 創薬

DrugAgentは、LLMによる計画立案とドメイン知識に基づくコード生成を組み合わせ、創薬分野の機械学習ワークフローを構築・評価する研究用マルチエージェントフレームワークです。

分子特性予測 · 創薬

STELLAは、生物医学文献とバイオインフォマティクスのワークフローを対象とした研究用マルチエージェントフレームワークです。再利用可能なワークフローテンプレート、ツールのオーケストレーション、批評、任意の動的なツール作成を組み合わせています。

文献・研究 · 創薬

NovoMCPは、MCPとRESTを通じて計算化学ツールを提供し、分子プロファイリング、設定可能なシミュレーションサービス、創薬ファネルのオーケストレーション、ツール呼び出しの監査を組み合わせています。

計算化学 · 創薬

PocketScout MCPは、公開されている構造、生物活性、保存性、変異、文献のデータを用いて既知のタンパク質結合部位を評価するためのツールをAIアシスタントに提供し、標的選定や結合タンパク質設計を支援します。

創薬 · 科学データ

PubMed MCP (cyanheads) は、AI クライアントを生物医学文献検索、論文メタデータ、利用可能な全文、MeSH 語彙、引用ツールに接続するサードパーティ製 MCP サーバーです。

文献・研究 · 創薬

RCSB MCP (cnyambura) は、RCSB PDB のエントリおよびポリマーのメタデータ、構造ファイルのダウンロード、カスタム Data API クエリを MCP クライアントに提供するサードパーティ製 MCP サーバーです。

創薬 · 科学データ

UniProt MCP (cyanheads) は、AI クライアントを UniProt のタンパク質検索、注釈、識別子マッピング、プロテオーム、分類学、アミノ酸配列に接続するサードパーティ製 MCP サーバーです。

創薬 · 科学データ

Chemistry42 は、生成的設計、逆合成、ADMET と選択性の予測、物理ベースの優先順位付けを組み合わせた小分子創薬プラットフォームで、ヒット同定とリード最適化を支援します。

分子生成 · 創薬

Makya は Iktos の、de novo 分子設計向け生成 AI SaaS プラットフォームです。プロジェクト目標、合成制約、リガンドベースまたは構造ベースのモデリングを組み合わせて、化合物選定を支援します。

分子生成 · 創薬

AutoDock Vinaは、VinaおよびAutoDock4.2スコアリング、複数リガンドのドッキング、マクロサイクル対応、Python 3バインディングを備えたオープンソースの分子ドッキング・バーチャルスクリーニングプログラムです。

創薬

FEgrowは、自由エネルギー計算の準備に向けたリガンド系列の対話的な構築を支援します。文書化されたアクティブ・ラーニングの例に加え、分子設計ワークフロー向けのDaskベースの高速化機能を備えています。

分子生成 · 創薬

DeepPurpose は、化合物およびタンパク質の予測モデルをトレーニングして適用するための PyTorch ベースのツールキットで、薬物-標的相互作用、分子特性、ドラッグリポジショニング、バーチャルスクリーニングのワークフローを備えています。

創薬

TorchDrugは、SMILES入力、グラフ操作、物性予測の構成要素、および複数のCPU/GPUでの実行に対応する、PyTorchベースのグラフ・分子機械学習ツールキットです。

分子特性予測 · 創薬

ChEMBL データとケモインフォマティクスサービスのクエリに使用する、ChEMBL グループが保守する公式 Python クライアント。QuerySet 形式のフィルター、遅延取得、ローカルでの結果キャッシュを備えています。

創薬 · 科学データ

ChEMBL MCP (cyanheads) は、MCP クライアントを ChEMBL の化合物、標的、生物活性、医薬品の記録に接続し、構造検索と、オプションで DuckDB を用いた大規模な活性データセットの分析を提供します。

創薬 · 科学データ

Therapeutics Data Commons は、治療分野の機械学習データセット、Python ローダー、データ分割、評価指標、ベンチマークを提供し、予測や分子生成の研究を支援します。

分子特性予測 · 創薬